请参阅我们的细胞分选和RNA提取指南。该指南用于指导如何获取用于arm-PCR扩增的模板RNA,同时包括了关于各种细胞类型的细胞计数和如何使用磁珠进行筛选等基本信息。
我们建议使用BD的K2-EDTA抗凝管(紫头管)进行常规采血(血液样本应在24—48小时内处理)。如果您需要离心,也可以使用BD的CPT管。我们也曾使用PaxGene管或Tempus管进行RNA提取并获得了较好的结果。应避免使用肝素抗凝管(绿头管),其对后续的RNA提取可能有抑制作用。
这取决于您的研究方案。为了让我们的引物体系作用于更多的受体,我们并不需要分选细胞。细胞类型可以是外周血白细胞、PBMC,或组织RNA。基本上,任何一个有T细胞或B细胞的样本,我们都有一个对应的样本扩增实验流程。细胞分选可以减少RNA的加样量,因为经分选的细胞中免疫特异性RNA的量大于来自组织的RNA。来自组织的RNA可能含有少量的TIL和许多无关的RNA。iPair需要分选细胞,除非采用iRep的从冷冻保存的细胞中进行细胞分选和单细胞分离至平板服务。
产品或服务均包含免疫组数据分析服务,需要进行数据分析的客户必须提交原始数据及数据分析所需信息。如何提交数据和信息表请参阅我公司网站:资料中心>数据分析>“数据分析指南”。
任何情况下,我们均可提供拆分后的数据(例如,您的样本条码对应的数据)。如购买了整个测序通道或服务通道,我们可以免费与您共享原始测序数据。共享原始数据的需求请尽量在数据开始分析的3个月内提出,超过时限需额外付费。
iRweb和iPair Analyzer软件使用了从IMGT数据库提取的参考序列。其中只有功能性基因被纳入分析中,省略了ORF和假基因。
分析中包括Shannon Entropy的计算,但包含在D50的图形输出中。这部分分析只能通过我们的在线分析软件iRweb获得。