iR全自动建库系统通过iR全自动建库仪和iR卡盒自动化完成免疫组NGS的文库构建。全自动、封闭式、一次性的设计，无需复杂的操作，为终端用户提供了一步式建库解决方案。由于文库构建和产物纯化均在卡盒中完成，iR全自动建库系统不仅能够有效防止污染、避免差错，而且能够显著节约时间。
每个iR卡盒（iR-Cassette）包含构建文库所需试剂（除RT-PCR1酶）以及文库产物纯化试剂。结合iR全自动建库仪（iR-Processor），iR卡盒可自动完成RT-PCR1、PCR1产物回收、PCR2和文库产物纯化等操作。
iR全自动建库仪有4个独立的卡槽，可同时或随机处理多个iR卡盒。最多一次可以同时处理四个样本。
操作人员将他们的模板RNA与RT酶混合并添加至iR卡盒。将卡盒放入自动建库仪，建库仪可根据卡盒顶部的条形码确定运行程序。仪器自动完成RT-PCR1、PCR1产物回收、PCR2和文库产物纯化等操作。操作人员将iR卡盒从自动建库仪中移出，放置在磁性支架上，并将文库产物从卡盒中转移到干净的PCR管中，该文库产物可直接用于定量、QC和高通量测序。